保护区维管束植物有155科748种，其中蕨类植物有18科62种、裸子植物4科4种被子植物133科682种。其区系组成主要为亚热带成分，如樟科、壳斗科、金缕梅秆、大楼科、山茶科、蔷蔽科、冬青科、漆树科、西草抖、桑科、松科、杉科等科植物，尤以木本成分丰富而复杂。虽大部分为亚热带成分，但有不少热带成分．如番荔枝科、苏木科、棕搁科等科植物．而发现温带成分。顶极植被为季风常绿闹叶林，虽遭破坏，但在七里程尚保留有原始性的次生林。其他有马层松针叶林和毛竹林。植物区系分区属 I E14。属国家保护植物二级有观光木、伯乐树，三级有粘木、白桂木、巴哉天等。其他珍稀树种有蓝果树科的紫树、蝶形花科的小叶红豆、金缕梅科的马蹄荷等。经济植物中用材树种有刺柏、南岭样等，药用植物有巴朝天、七叶一枝花等，野生果类行山荔枝、酸枣、山竹子、猕猴桃等。
